海南疾控基因测序组:溯源追踪 一锤定音

2022年8月1日,三亚市报告一例新冠肺炎确诊病例,为了快速查明疫情传播源头,海南省疾控中心检验检测所基因测序小组第一时间对该例病例样本进行了全基因组测序,确定为国内首次发现的VOC/Omicron变异株BA.5.1.3进化分支,为科学制定海南省本轮疫情防控策略提供了可靠的病原学溯源依据。

海南省疾控中心检验检测首席专家马焱介绍,省疾控中心采用的二代测序也称为全基因组测序,能够提供病毒最完整的基因信息,需要经过核酸提取、反转录和扩增、纯化、文库构建、上机、结果比对分析等9大步骤。前6个步骤需要在实验室里连续工作12个小时才能上机,再经过26个小时的不间断测定,得到病毒的全基因组序列,还需要3个小时进行序列拼接和分析比对,才能得出最终结果,并报中国疾控中心病毒病所复核。整个操作过程复杂、科学、严谨,要求精神高度集中,认真仔细,确保每个环节准确无误。

基因测序小组李丹丹、孙初阳、蔡英桂、苏林梁、邝仕壮、崔蕾等6名组员,发扬党员的表率示范作用和疾控人勇于担当的精神,把困难当作试金石,把压力化作团队凝聚办,密切配合、相互支撑,圆满地完成了一次次测序任务。截至8月26日,基因测序小组共完成106例病例标本测序,仅“0801”疫情就检测了44例。

海南疾控基因测序组:溯源追踪 一锤定音

李丹丹既是检验检测所的副所长,也是测序小组的掌舵人。主持基因测序仪的技术参数论证、配合开展仪器安装培训,组织测序小组成员开展预实验,直至正式开展新冠病毒测序。在他的带领下,省疾控中心成功开展新冠病毒全基因组测序,标志着海南省疾控中心在分子生物学检测技术方面有了质的飞跃,填补了海南省内在全基因组测序领域的空白,提升了溯源追踪,一锤定音的能力。

海南疾控基因测序组:溯源追踪 一锤定音

孙初阳是检验检测所微生物检验室副主任技师,对测序得到的全基因组序列进行比对分析是孙初阳在测序下机后最重要的工作。细微中见真知,在电脑前从上万个碱基中查找突变位点,从数据库中比对病例的来源,及时出具比对结果。作为测序小组主力成员的她,通过“传帮带”,使其他组员熟练掌握了新冠病毒全基因组测序技术和分析要领。

海南疾控基因测序组:溯源追踪 一锤定音

苏林梁是检验检测所毒理室负责人,毒理室日常管理和毒理学实验操作是她的日常工作。虽然在毒理室从未接触过基因测序技术,但是现在已经能熟练掌握病毒测序的各个环节的操作,是她平时认真学习、努力拼搏的结果,实验笔记中详实的实验数据是她奋战的每一个日夜最好的证明,她用坚守、严谨、科学和默默付出诠释了一名共产党员的责任和担当。

崔蕾是检验检测所微生物检验室负责人,在核酸检测、病毒测序、科室管理等不同角色间转换,作为2个孩子的母亲,刚休完产假就以饱满的工作热情和严谨的工作态度进入抗击疫情的战斗状态。

海南疾控基因测序组:溯源追踪 一锤定音

蔡英桂是测序组唯一的90后,更是团队中的骨干力量。参加工作3年,有两年多奋战在实验室,与实验仪器,病毒样本为伴,实验中反复琢磨每个细节,不断优化实验流程,看似弱小的她却有着最坚毅的信念,用青春的激情和智慧与病毒斗智斗勇,用实际行动谱写青春无悔,不负韶华。

团队中还有一位准新郎邝仕壮。面对疫情,多次推迟筹办婚礼,一直坚守在工作岗位上。一对新人舍小家顾大家,折射出新时代青年的责任与担当。

面对来路不明,去向不定的新冠病毒,基因测序势必让它无所遁行。他们在实验室坚守岗位、默默付出,为阳性病例溯源追踪发挥“一锤定音”的作用,不愧是抗击疫情的幕后英雄!

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